Chise es una joven estudiante con un secreto. Un secreto que no tiene que ver nada con los que se suelen tener a su edad. Ella es el arma definitiva, el último recurso defensivo de Japón contra las amenazas exteriores. Cuando el país la necesita, su cuerpo se transforma en una máquina de combate letal... La cuestión es si ella y los que la rodean podrán sobrevivir a ese gran secreto.